由上海市人民政府與世界健康基金會(huì )于上世紀九十年代立項建設，1998年正式建成對外開(kāi)放?，F有31個(gè)臨床科室，規劃床位規模1500張，實(shí)際開(kāi)放788張，是我國兒童先心病、血液/腫瘤和發(fā)育行為兒科領(lǐng)域最高水平的中心之一，擁有6個(gè)國家重點(diǎn)學(xué)科、國家臨床重點(diǎn)專(zhuān)科，是國家首批“211工程”、“985工程”及“雙一流”兒科重點(diǎn)建設學(xué)科。2010年成為國內首家通過(guò)JCI國際醫院認證的兒童專(zhuān)科醫院，2017年醫院獲批成為國家兒童醫學(xué)中心，2018年問(wèn)鼎上海市政府質(zhì)量金獎，2021年以總分903.8分位列全國兒童專(zhuān)科醫院第一，2019年、2020年、2021年連續三年榮登“榜首”。在單項排名中，醫院CMI指數和四級手術(shù)人數均排名第一。